NCBI常用的序列搜索比对工具是BLAST。

BLAST是NCBI中常用的序列搜索比对工具，用于在DNA、蛋白质等生物信息学领域进行序列比对和相似性搜索。BLAST通过算法对输入的序列进行比对，在数据库中找到相似的序列。该工具广泛应用于基因功能研究、物种鉴定、蛋白质相互作用等领域。以下是关于BLAST的详细介绍：

BLAST作为NCBI的核心工具之一，对于生物信息学研究者来说至关重要。它能够快速准确地搜索和比对生物序列，帮助研究者找到相似的基因或蛋白质序列。该工具不仅适用于科研人员，也适用于广大生物学爱好者以及需要基础生物信息学知识的其他领域的研究人员。BLAST的应用范围非常广泛，从基因组学到蛋白质组学，从基础研究到临床应用，都发挥着不可替代的作用。

其强大的搜索功能使研究者能够快速获取有关基因或蛋白质的信息，为后续的分子生物学实验和数据分析提供了重要支持。NCBI还提供了多种不同类型的BLAST工具，如用于核酸序列比对的BLASTn、用于蛋白质序列比对的BLASTp等，以满足不同研究需求。这些工具的使用非常简单，用户只需在NCBI网站上的BLAST界面输入待查询的序列，选择相应的数据库和比对参数，即可快速获得比对结果。这些结果可以帮助研究者了解序列的相似性和进化关系等重要信息。

总的来说，NCBI的BLAST工具是生物信息学领域非常重要的序列搜索比对工具，对于生物学研究和相关领域的探索具有重要意义。

【答案】：主要分析工具有：①Find genes工具：帮助快速寻找指定基因的功能；②Cluster heatmap工具：聚类图分析工具；③Query Group A versus B工具：两个子集比较下的查询工具。④Experiment design and Value distribution：实验设计和数据分布查看工具，用户可大概了解一个数据集的数值分布状态。⑤GEOBLAST，GEO数据比对工具，供用户使用BLAET搜索感兴趣的核苷酸序列的相似序列的GEO基因表达谱。⑥Subset effects：子集效应。如果不同子集间的基因表达值或秩次存在显著性差异，那么这些表达谱会被自动标记，用户可以通过这个特性检索所有相关的表达谱。

任何web软件和应用程序都需要强大的数据库管理工具，因此开发者选择一款合适的数据库管理工具尤为重要。北京电脑培训列出了几款好用的数据库管理工具（有些并非开源或免费），以供开发者们参考选择：

1、MySQL管理工具phpMyAdmin

phpMyAdmin是一个非常受欢迎的基于web的MySQL数据库管理工具。它能够创建和删除数据库，创建/删除/修改表格,删除/编辑/新增字段，执行SQL脚本等。

缺点：

SQL语法不高亮

2、数据库管理工具NavicatLite

Navicat是一套快速、可靠并价格相宜的资料库管理工具，大可使用来简化资料库的管理及降低系统管理成本。它的设计符合资料库管理员、开发人员及中小企业的需求。Navicat是以直觉化的使用者图形介面所而建的，让你可以以安全且简单的方式建立、组织、存取并共用资讯。Navicat支持的数据库包括MySQL、Oracle、SQLite、PostgreSQL和SQLServer等。

Navicat提供商业版NavicatPremium和免费的版本NavicatLite。但目前Navicat已不再提供LITE版本。

缺点：

免费版本已停止更新。

3、数据库管理工具DBeaver

DBeaver是一个通用的数据库管理工具和SQL客户端，支持MySQL,PostgreSQL,Oracle,DB2,MSSQL,Sybase,Mimer,HSQLDB,Derby,以及其他兼容JDBC的数据库。DBeaver提供一个图形界面用来查看数据库结构、执行SQL查询和脚本，浏览和导出数据，处理BLOB/CLOB数据，修改数据库结构等等。

4、MySQL数据库建模工具MySQLWorkbench

MySQLWorkbench是数据库架构师和开发人员的可视化数据库设计、管理的工具，它是著名的数据库设计工具DBDesigner4的继任者。你可以用MySQLWorkbench设计和创建新的数据库图示，建立数据库文档。它同时有开源和商业化的两个版本。可以在Windows，Linux和MACOSX上使用。

它在2016年十月份成为一个稳定的工具。

缺点：

比phpMyAdmin更复杂。

1.oracle sql developer:甲骨文官方出品,优点在于:精准书签,可方便设置...

2.pl sql developer:集成开发环境,专用于oracle数据库存储的程序单元...

3.toad:收费工具。精确书签、自动大小写关键字、可设智能提示范围、语法纠错等。

4.EnterpriseManager,企业管理器,图形化数据管理。

5.si object browser:在图形用户界面上对数据库对象创建编辑,可高效辅助开发...